As Facções

X-Men
Os X-Men sabem como cuidar um dos outros e estão dispostos a se sacrificarem por seus amigos. Quando dois X-men estão adjacentes um do outro, eles podem trocar um clique de dano entre si. Um X-man sofre um clique de dano enquanto o outro recebe um clique de cura.
Sindicato Sinistro
A antítese dos Defensores, o Sindicato Sinistro pode elevar o valor de seus ataques para cada membro da equipe adjacente.
Só um lembrete: o Bullseye veterano possui um valor de ataque inicial 11.
Quarteto Fantástico
Os heróis desta equipe não gostam quando você fere um de seus aliados. Sua habilidade de equipe torna a derrota de um de seus membros um custo muito caro para o adversário pagar.
Não há nenhum herói do Quarteto Fantástico na coleção Infinity Challenge, mas espere para vê-los mais tarde.
Vingadores
Conservação de ações é importante em HeroClix. Quanto mais ações você tiver em seu turno, mais chances você terá de atingir seus objetivos, e os Vingadores são ótimos para essa estratégia. A Habilidade de Equipe desses heróis deixa isso bem claro: Qualquer Vingador pode se mover sem usar uma ação naquele turno.
Irmandade dos Mutantes
A habilidade da Irmandade dos Mutantes é semelhante a dos Vingadores. Só que personagens como Magneto podem causar mais medo do que qualquer trabalho de equipe. Ainda mais com a ajuda de Sabretooth (Dente de Sabre) e Juggernaut (Fanático) que podem usar seus movimentos livres para fazer ataques a distância devastadores.
Lacaios do Doutor Destino
Os Lacaios do Doutor Destino usam a influência de Destino para se adaptarem a qualquer situação, tornando-os facilmente líderes de equipes. Você quer um esquadrão de Hidra? Coloque Annihilus junto deles aumentando seus ataques à distância. Você gostaria que seu Sindicato Sinistro tivesse um valor mais elevado de ataque? Coloque o Ultron experiente para ajudá-los. Os Lacaios do Doutor Destino são flexíveis para qualquer equipe.
Defensores
Similar a habilidade especial de Defesa, todos os Defensores podem aumentar seus valores de proteção para cada Defensor que estiver perto de si. Dessa forma, Hulk pode ajudar na defesa de Dr. Strange e vice-versa.
Skruls
Os membros dos Skruls possuem uma chance em seis de escapar de qualquer ataque. A unidade atacante não perde sua ação se a defesa for um sucesso, ele pode escolher outro alvo ou realizar uma outra ação. Skruls são relativamente indispensáveis, sendo muito úteis em equipes que usam táticas de "bucha-de-canhão".
Homem-Aranha
Os heróis da equipe do Homem-Aranha são os que melhor trabalham com os outros. O Homem-Aranha e os outros membros que pertencem à sua equipe agem como coringas. Eles podem usar as habilidades de equipe de qualquer figura aliada que estiver em jogo, e podem usar mais de uma habilidade diferente por turno.
S.H.I.E.L.D.
Os soldados da S.H.I.E.L.D. tornam seus ataques à distância realmente mortíferos. Eles aumentam a potência do ataque de uma figura aliada em um clique de dano. Seu Cyclops (Ciclope) precisa de algum reforço? Coloque duas unidades da S.H.I.E.L.D. atrás dele e lance um raio óptico realmente destrutivo. Diferente da Hidra, a S.H.I.E.L.D. é usada para representar as boas organizações como um departamento de polícia.
Hidra
A equipe Hidra representa as organizações malignas do universo de Marvel Heroclix, por isso, não fique surpreso ao ver grupos como este no futuro. Com sua habilidade de equipe, os membros da Hidra elevam seus valores de ataque quando estão acompanhados uns dos outros. Quanto mais hidras estiverem adjacentes ao personagem, mais forte ele/ela fica.